求大神指导Lnc RNA和miRNA用什么软件或者网站取交集?

1.4 利用limma包对重复基因取平均值。1.5 行名重命名，提取前15位。1.6 按病人ID进行分组。模块二. 区分mRNA、lncRNA和miRNA：从ENSEMBL数据库（asia.ensembl.org/）获取不同RNA类型。利用vega.archive.ensembl.org...，通过`gene_biotype`注释类型，最终汇总至`EXCEL`文件。2.1 读入EXCEL文件的...

此外，LncPheDB提供了一个高度互动的视觉交互网络，帮助用户识别lncRNA、miRNA、蛋白质、基因及其他功能元件之间的潜在关系。同时，还提供了四个新生物信息学工具的链接，增强数据浏览和搜索功能。通过LncPheDB等网站，研究者能够更深入地理解lncRNA与蛋白质或mRNA的相互作用，为相关领域的研究提供了强大的支...

microRNA的调控机制是：细胞产生一段双链RNA成为miRNA（也可以是体外注射的双链RNA，成为siRNA，即RNAi技术）miRNA前体经过Drosha 核算酶，Exportine运输蛋白运出细胞核，细胞质中的Dicer核算酶作用成为miRNA，后经过细胞质的解螺旋酶的作用，变为单链RNA，触发RISC复合体，寻找与miRNA互补的RNA，一旦发现可以...

CeRNA网络中，如miRNA-mRNA-lncRNA-circRNA的相互作用，通过富集分析筛选出潜在的相互作用，考虑序列相关、表达量变化和miRNA结合富集程度。ceRNA分析的核心是理解其对mRNA表达调控的影响，以揭示在生物学问题中的具体作用，如心脏发育过程中的基因调控。基迪奥提供ceRNA研究的深度解析案例和5月线上培训班，包括...

miRNA测序分析则涉及到关键数据库及软件的应用，揭示miRNA在转录后调控中的作用。lncRNA及circRNA测序侧重于非编码RNA的表达特征研究，关注其在基因表达调控中的独特机制。多组学关联分析结合mRNA、miRNA、lncRNA及circRNA之间的相互作用，深入探讨转录调控的复杂网络。通过这些分析，可以揭示不同生物体或疾病状态...

IncRNA主要由RNA聚合酶II转录生成，并经过剪接加工，形成具有类似于mRNA结构的分子，通常含有poly A尾巴和启动子结构，但缺少开放阅读框（ORF）。这类RNA在多种生物过程中发挥关键作用，如表观遗传调控、转录调节、转录后调节以及翻译后调节等。IncRNA的作用机制多样，涉及与mRNA、DNA、蛋白质和miRNA等分子...

而不论是lncRNA还是miRNA，要进行功能注释，首先都需要预测其靶基因，靶基因的预测往往是基于各种各样的数据库的，为了提高预测准确性，就会把各个数据库的预测结果取一个交集，比如我们做有关miRNA靶基因的预测可能会用到TargetScan，miRTarBase，starBase等等数据库，Venn图就能够很直观清楚的反应我们的筛选...

miRNA作用算是RNAi的一种方式。 miRNA的识别位点是mRNA的3'UTR，作用方式也是转录后抑制（翻译抑制），所以应该算是RNAi。miRNA是体记忆体在的RNAi。 现在实验常用的反义RNAi技术是外源汇入的，用siRNA或者shRNA，识别位点是mRNA的CDS，是比miRNA更强的mRNA降解而非抑制机制。RNA沉默用shRNA, RNA干扰...