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GRCH-321

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参考基因组序列名GRCh38,hg38,GRCh37,hg19怎么区分

GRCH37，b37和hs37d5：可以将hs37d5理解为b37的升级版，b37为GRCH37的升级版。b37在GRCH37的基础上进行命名和坐标系统规范，包括线粒体和GL开头的一些没有定位到基因组的序列；hs37d5在b37基础上增加了一条病毒序列（...

胎儿脐带染色体检查 seq[GRCh37](1-22)×2,(XN)×1是什么意思?

[GRCh37]，表示参考基因组的版本号；(1-22)×2，表示常染色体1-22号染色体各有两条（正常人都是各有两条）；(XN)×1，表示性染色体有一对，性别保密（N），正常人都是有一对；合起来的意思就是染色体正常。

请问这个染色体检测结果怎么读:46,XY,del(15q11.1q13.1).seq[GRCh...

del(15q11.1q13.1)：指15号染色体q11.1到15号染色体q13.1位置片段缺失；seq[GRCh37/hg19](20,415,466-28,406,915)×1：指以GRCh37/hg19的人类参考序列为蓝本，15号染色体20,415,466-28,406,915位置为1拷贝（也...

blast的结果

>NC_000017.11:c44389649-44372181Homosapienschromosome17_ITGA2B_7core,GRCh38.p13PrimaryAssembly Length=1773 Score = 329 bits (178), Expect = 5e-92 Identities = 179/180 (99%), Gaps = 0/180 (0%) Strand=Plus/Minus...

HiC数据分析之-HiC-Pro

bowtie2-build 1.fa,2.fa,...,MT.fahuman_GRCh37 2. 准备annotation文件要有两个：第一个是：HindIII_resfrag_hg19.bed 主要通过软件包里面script 生成 python/gpfs01/software/bio/HiC-Pro...