blast swiss prot

1 相似性比对用blast 注意限定条件，注意：blast时必须是fasta格式 2 对给出的氨基酸序列进行相似性比较，确定其编码的蛋白质 blast限定（swiss prot)3 搜索不同物种的同源基因 用blast注意advanced加限制条件（organism; gene...

PIR提供三类序列搜索服务：基于文本的交互式检索；标准的序列相似性搜索，包括BLAST、FASTA等；结合序列相似性、注释信息和蛋白质家族信息的高级搜索，包括按注释分类的相似性搜索、结构域搜索GeneFIND等。2. SWISS-PROT SWISS-P...

SWISS-PROT是含有详细注释内容的蛋白质序列数据库，由欧洲生物信息学中心（EBI）维护，目前已合并入 UniProt数据库，旨在帮助基因组和蛋白质组以及相关的分子生物学研究人员提供有关蛋白质氨基酸序列的最新信息。SWISS-PROT中尽可...

InterProScan：蛋白质结构域和功能位点的集成数据库，它将SWISS-PROT、TrEMBL、PROTSITE、PRINTS、PFAM、ProDom等数据库提供的蛋白质序列中的各种局域模式，如结构域、基序等信息统一起来，提供了较为全面的分析数据。blastp：...

swiss-prot:最齐全的注释精炼的蛋白序列数据库，建立于1986年，1987年起由日内瓦大学(University of Geneva)医学生物化学系和 EMBL 数据馆(即现在的欧洲生物信息研究所EBI)共同维护。cos:欧洲药典适用性证书（COS，即Certificate...

然后就是蛋白质的了一般都在expasy里swiss-prot 适用于检索的 compute pi/mw 求理论分子量 分子量 protparam物理化学性质 protscale亲水性疏水性 peptidemass分析蛋白酶和化学试剂处理后的内切产物 NCBI(www.ncbi.nlm.nih....

将PIR、SWISS-PROT和TrEMBL3个蛋白质数据库统一-起来组建而成，包含3个部分:(1)UniProt Knowledgebase (UniProtKB)，这是蛋白质序列、功能、分类、交叉引用等蛋白质知识库，记录经过人工筛选和注释;■ (2)UniRef (UniProt ...

SI B 在1996年推出了SWISS 2PROT 的补充数据库T rE BM L ,T rE BM L 是由计算机将E M BL 数据库中除了编码SWISS 2PROT中已有序列以外的所有编码序列(C DS )翻译并注释而形成的,所以其注释的准确性比SWISS 2PROT 低[5]。

分子生物学的三大核心数据库是GenBank核酸序列数据库，SWISS-PROT蛋白质序列数据库和PDB生物大分子结构数据库，这三大数据库为全世界分子生物学和医学研究人员了解生物分子信息的组织和结构，破译基因组信息提供了必要的支撑。但是...

GenBank核酸序列数据库；SWISS-PROT蛋白质序列数据库；PDB生物大分子结构数 据库；2、简述生物信息学的发生和发展。20世纪50年代，生物信息学开始孕育；20世纪60年代，生物分子信息在概念上将计算生物学和计算机科学联系起来；20...