exons

-Q 对于-M 选项:移除包含关系的转录本的限制条件:多外显子转录本将会合并,如果他们内含子位置完全一样,单外显子转录本只需要有80%一样即可合并。 --force-exons: 使GFF features的最小层级为exon -E 对于重复的 ID或者 GFF/GTF 其他潜在的格式问题给出警告信息。 -Z 将内含子小于4 bp的邻近的两个外显子...

GFF3的官方介绍： Generic Feature Format Version 3 （GFF3）GFF3格式文件为文本文件，分为9列，以TAB分开。控制符使用 RFC 3986 Percent-Encoding 编码。比如：%20 代表着ASCII的空格。9列文件依次是：1. seqid：参考序列的id。该id的取名不能以’>’开头，不能包含空格。2. source ：注释...

<ht2_base>        要写入的索引文件的basename；默认情况下，hisat2-build写入文件名为NAME.1.ht2, NAME.2.ht2, NAME.3.ht2, NAME.4.ht2, NAME.5.ht2, NAME.6.ht2, NAME.7.ht2, NAME.8.ht2的文件。<ht2_base>就是文件前缀NAME。选项 1.-f 参考基...

CHRNB2 as candidate genes and DNA sequencing was performed on the 5~ exons in 13 families of 18 idiopathic nocturnal frontal lobe epilepsy cases, 23 sporadic idiopathic nocturnal frontal lobe epilepsy cases and 26 first degree relatives.