isoform

FPKM与RPKM计算方法基本一致。公式如下：其中C是map至该基因的外显子上的片断数，N是所有map至基因组的测序reads的碱基数，L就是该基因外显子碱基全长。在cuffdiff中，它会将同一组中所有的样品试为同一来源样品处理，这就是为什么同一组内如果有三个样品的话，最终得到FPKM值并不是三个样品单独运算...

锌指结构有结合DNA的功能，谷/脯氨酸富含区则发挥转录调控功能。WT1锌指结构结合的靶序列是GCGGGGGCG，它存在于许多生长调控因子基因的启动子内。WT1基因通过2种可变剪接形式产生4种 mRNA转录体，编码4种蛋白同工体(isoform)。第一种可变剪接在锌指区和谷/脯氨基酸富含区插入一段由第5外显子中51bp编码...

Yang Y and Zhou T.* (2010). The L279P Mutation of Nuclear Distribution Gene C (NudC) Influences Its Chaperone Activity and LIS1 Stability. Journal of Biological Chemistry 285(39):29903-29910. (最新影响因子: 5. 328)3. Ding L, Xu Y, Zhang W, Deng Y, Si M, Du Y, Ha...