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如何理解通过计算kaks来估计基因的选择压力

如何理解通过计算kaks来估计基因的选择压力:将非同义替换的数量除以同义替换的数量。

分析| kaks 计算

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芬兰玻璃穹顶小屋介绍

在解决了Kaks和全球大火的一大技术难题后,芬兰的玻璃小屋如雨后春笋般遍布全国。位于圣诞老人家乡的北极玻璃冰屋就是其中的杰出代表。北极玻璃冰屋(ArcticGlassIgloos)于2014年开始营业,其设施比Kaks的旧房间要新得多。借鉴Kaks的经验,酒店的...

手机套哪个牌子好?

4.qialino手机套(十大手机套品牌,qialino);5.MOBY手机套(十大手机套品牌,MOBY);6.倍克贝克手机套(十大手机套品牌,倍克贝克);7.MCWL手机套(十大手机套品牌,MCWL);8.kaks手机套(十大手机套品牌,kaks);9.baohuzhe手机套(...

KaKs_Calculator2.0 做ka/ks过程的一点记录

具体来说,使用KaKs_Calculator2.0 做ka/ks的大致过程分以下几步 1选择每个物种相同数目的cds编码区,每个物种的cds应首先去除终止子,然后按照相同的基因顺序联合拼接 拼接过程要注意数目始终为3的倍数。2 导出每个物种cds...

如何把aln文件转成axt文件以行KaKs之用

尝试如下方法:你可以用clustalX存为aln格式,然后用其自带的AXT (我已经编译成windows可执行文件,见附件)转换器。然后再作为输入运行kaks计算器。应该没有问题。Note: 重新用MinGW编译了,在 winxp sp3 DOS 下测试可以运行...

Ks值用TBtools计算不出来?讲一个故事

KaKs的计算逻辑,其实很容易找到。最经典的莫过于NG法。具体可参考 但是无论使用什么算法,codon alignment是一定要的。因为 codon对 是基本计算单元。 上述用户提供的alignments,很明显,只是核酸水平的比对结果,不能用于...

和尚的袈裟有什么含义吗?

梵语kas!a^ya,巴利语kasa^ya 或 kasa^va。意译作坏色、不正色、赤色、染色。指缠缚于僧众身上之法衣,以其色不正而称名。又作袈裟野、迦逻沙曳、迦沙、加沙。(一)颜色:袈裟之颜色在诸律中各有异说,然大抵赞同...

2019-07-06

Kaks_calculator K-estimator 其他 snp搜索软件列表:polyphred SNPdetector BGI-Variation analysis 非同义替换率(氨基酸改变,dn)与同义替换率的(氨基酸不改变,ds)的比值(dn/ds)也经常被用于分化分析。dn/ds的比值为1...

怎么利用kake将ae高版本转化为低版本?

这是一个一劳永逸的办法,安装了高版本,所有工程都能打开,都能向下兼容,如果你又Adobe Creative Cloud那就简单了,只需要打开点击升级,他就会自动升级安装。
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